Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm14E9Q3T6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prdm14E9Q3T6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm14E9Q3T6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms