Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms