Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3893E9Q1I1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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