Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf11E9PZM7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms