Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srp54bE9PXC0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms