Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc78D3Z5T1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc78D3Z5T1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc78D3Z5T1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc78D3Z5T1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc78D3Z5T1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms