Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-2D3Z4R4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms