Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm1330D3Z460 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms