Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms