Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc170D3YXL0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms