Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SafbD3YXK2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms