Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms