Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700006A11RikB9EHI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700006A11RikB9EHI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700006A11RikB9EHI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700006A11RikB9EHI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700006A11RikB9EHI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms