Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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