Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah3B2RWG3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms