Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap58B2RW38 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms