Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms