Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms