Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H60cB1B213 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms