Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2012B1B0R1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2012B1B0R1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms