Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfx1B1AY10 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfx1B1AY10 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfx1B1AY10 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfx1B1AY10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfx1B1AY10 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfx1B1AY10 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfx1B1AY10 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfx1B1AY10 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms