Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NhsB1AV60 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NhsB1AV60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms