Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Trabd2bB1ATG9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Trabd2bB1ATG9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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