Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms