Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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