Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms