Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl41A2AUC9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl41A2AUC9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl41A2AUC9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl41A2AUC9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl41A2AUC9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl41A2AUC9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl41A2AUC9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klhl41A2AUC9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klhl41A2AUC9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klhl41A2AUC9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klhl41A2AUC9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klhl41A2AUC9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms