Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn3aA2ASI5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms