Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SktA2AQ25 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SktA2AQ25 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SktA2AQ25 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SktA2AQ25 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SktA2AQ25 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SktA2AQ25 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SktA2AQ25 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SktA2AQ25 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SktA2AQ25 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SktA2AQ25 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SktA2AQ25 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SktA2AQ25 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SktA2AQ25 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SktA2AQ25 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SktA2AQ25 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SktA2AQ25 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SktA2AQ25 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms