Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtf1A2AQ19 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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