Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam205aA2APU8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam205aA2APU8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam205aA2APU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms