Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c4A2ANA3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms