Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VirmaA2AIV2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms