Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Brwd3A2AHJ4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brwd3A2AHJ4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms