Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rhbdl2A2AGA4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms