Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms