Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2dnl1A2AFH1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms