Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef6A2A8M8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms