Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm2A2A7B5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms