Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul4bA2A432 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms