Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms