Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms