Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Hdac5Q9Z2V6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms