Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Letm1Q9Z2I0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Letm1Q9Z2I0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms