Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtmr1Q9Z2C4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr1Q9Z2C4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms