Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn6Q9Z262 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn6Q9Z262 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms