Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms