Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stk39Q9Z1W9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk39Q9Z1W9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms