Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms