Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lgr5Q9Z1P4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms